صدر قرار معالي مدير الجامعة رقم 1229 بتاريخ 11/ 7 /1436هـ بإنشاء إدارة التخطيط الاستراتيجي ثم حولت لتكون الإدارة العامة للتخطيط الاستراتيجي بالقرار رقم ( 1762 ) وتاريخ 16/12/1439 لتتولى منظومة التخطيط في الجامعة ، وإعداد الخطط الاستراتيجية والتشغيلية والإدارية والمالية للجامعة وتطويرها وقياسها وتقييمها بشكل دوري، ومتابعة تنفيذها بما يحقق أهداف الجامعة القصيرة والبعيدة المدى، وإعداد دليل خطة المخاطر ومتابعة تنفيذها، مع ارتباطها التنظيمي برئيس الجامعة .