منذ أن نشأت جامعة المجمعة والعناية بالتعليم وتطويره هدفها الرئيس, حيث تضمن الهيكل الإداري للجامعة عند إنشائها وكالةً مخصصة للشؤون التعليمية، وقد سعت جامعة المجمعة لتفعيل دور هذه الوكالة, حيث تم في شهر شوال من عام 1433هـ تكليف سعادة الدكتور محمد بن عبد الله الشايع مشرف عليها لتبدأ الوكالة في ممارسة دورها في الاهتمام بالتعليم في الجامعة, وفي يوم الأحد الموافق 14/4/1434هـ صدر قرار معالي مدير الجامعة, بتكليف سعادة الأستاذ الدكتور محمد بن عثمان الركبان وكيلاً للجامعة للشؤون التعليمية بناءً على موافقة معالي وزير التعليم العالي ــ رئيس مجلس الجامعة ــ وذلك للقيام بكافة المهام والاختصاصات المنصوص عليها في دليل الصلاحيات والاختصاصات, الصادر بالقرار الإداري لمعالي مدير الجامعة رقم 10 بتاريخ 1/7/1431هـ .
وتتبع وكالة الجامعة للشؤون التعليمية بشكل مباشر, كافة كليات الجامعة وهي ( كلية التربية بالمجمعة – كلية التربية بالزلفي – كلية الهندسة بالمجمعة – كلية الطب بالمجمعة – كلية العلوم الطبية التطبيقية بالمجمعة – كلية طب الأسنان بالزلفي – كلية العلوم بالزلفي – كلية المجتمع بالمجمعة – كلية إدارة الأعمال بالمجمعة – كلية العلوم والدراسات الإنسانية بالغاط - كلية العلوم والدراسات الإنسانية برماح - كلية العلوم والدراسات الإنسانية بحوطة سدير _ كلية علوم الحاسب والمعلومات بالمجمعة - وما يستحدث من كليات) كما يتبعها أيضاً العمادات المساندة ذات العلاقة, وهي : ( عمادة القبول والتسجيل –عمادة شؤون الطلاب – عمادة التعليم الالكتروني والتعلم عن بُعد ــ عمادة الجودة وتطوير المهارات – عمادة السنة التحضيرية) , كما يتبعها أيضاً, ( مركز تعليم اللغة العربية لغير الناطقين بها ).
وتضم الوكالة في مرافقها الداخلية عدداً من الإدارات المنظمة للعمل, والعديد من الوحدات الفاعلة واللجان النشطة والبرامج النوعية.