لبرنامج كراسي البحث استقلال مالي وإداري ، وذمة مالية وفق أحكام هذه اللائحة، وله ميزانية سنوية تتضمن موارده ومصروفاته وفق قيودها.
ويخصص لبرنامج الكراسي حساب رئيس في أحد البنوك الرئيسة ، تودع به إيرادات جميع الكراسي ، ولمدير الجامعة صلاحيات الصرف ، وله أن يفوض رئيس لجنة كراسي البحث العلمي بالصرف منه على كراسي البحث، وتعد السنة المالية للجامعة هي السنة المالية لبرنامج كراسي البحث العلمي.